本发明提供一种修复患病或功能紊乱的胰腺或肝脏的方法。所述方法包括从患者的健康组织或非自身供体的胆管树制备干细胞和/祖细胞悬液，例如胆管树干细胞、肝干细胞、胰腺干细胞或其子代、定向祖细胞，并将所述细胞植入要被治疗的器官附近的胆管壁中。该移植体由干细胞或祖细胞组成，并混合有适合于被植入的细胞的成熟谱系阶段的生物材料以及任选地具有细胞因子和/或天然的上皮细胞-间充质细胞。所述细胞被特异性地导入该对象的肝-胰腺总管以治疗胰腺病症，或导入至靠近肝脏的胆管壁以治疗肝脏病症，并允许细胞迁移至胰腺或肝脏，扩增并重构部分或整个患病或功能紊乱的器官。