本实用新型涉及了一种组织培养自动消毒机。传统的人工消毒需操作人员手动摇晃消毒罐以使消毒液与植物材料充分接触，这种消毒模式效率低、消毒液易与实验及工作人员接触，不利于劳动保护，且人工操作过程易导致二次污染。本实用新型其特征在于包括多个消毒液存储罐，每个消毒液存储罐分别通过管道连接至同一个外植体消毒液罐，每个管道上均设置输液电磁阀，所述外植体消毒液罐连接排液管，排液管上设置排废液电磁阀，所述的输液电磁阀和排废液电磁阀的开关由芯片控制，芯片外接控制面板。本实用新型实现了自动控制不同消毒阶段时间，隔离实验工作人员和消毒液，操作简单安全，有效提升了工作效率。