本发明涉及一种大蒜抗叶枯病体细胞突变体筛选方法。该方法包括：（1）以大蒜茎盘为外植体，以叶枯病粗毒素不同的体积分数为培养基，确定筛选压；(2)以大蒜茎盘为外植体，接种附加粗毒素体积分数为5％的培养基上诱导出抗性愈伤组织；（3）配置附加不同体积分数的粗毒素增殖培养基，将抗性愈伤组织接种上；（4）将得到的愈伤组织接种到不含毒素的愈伤组织增殖培养基中，淘汰掉非抗性的愈伤组织或细胞；（5）将抗性愈伤组织或细胞接种至粗毒素体积分数为25％的芽分化培养基中诱导芽的分化；（6）将诱导得到的抗性芽接种到不含毒素的芽分化培养基中；（7）将得到的抗性芽接种至MS基本培养基上，再生植株；（8）对再生植株进行分子水平的鉴定。