一种循环水系统高效杀菌组合物，包括壳聚糖N-羟丙基聚氧乙烯醚二烷基卤化物和快T，各组分的质量配比为：壳聚糖N-羟丙基聚氧乙烯醚二烷基卤化物50~90%、快T为1~10%、其余用去离子水补足。壳聚糖N-羟丙基聚氧乙烯醚二烷基卤化物结构式中n为100~600的整数、m为10~30的整数，R为-CH₃、-CH₂CH₃、-(CH₂)₂CH₃、-(CH₂)_、CH₃或-CH₂C₅H₆，X为Cl、Br或I。本发明公开的组合物具有安全环保生物降解、无毒、抗药性小的优点，能够对管道中顽固性粘泥快速渗透、杀菌、剥离，并分散在水中随水流一起排除系统。