本发明公开一种小分子富氢水的制备方法及其制备设备，氢气与饮用水进行初步均衡混合后形成初级气水混合液；进入离心泵中完成二次混合，使二次混合后的气水混合液通过高精度电自动冲洗过滤器及莲蓬式控制器喷口，使气水混合液形成高速有序线性运动,并互相碰撞完成第三次混合，三次混合后的气水混合液从小分子水制备器中流过，得到小分子水，将小分子水输送到反冲激气泡释放器通过反冲激气泡释放器制造出气泡直径200纳米至4微米的微纳米气泡，形成含微纳米氢气的气泡液，将微纳米氢气气泡液送入贮存容器底部,把微纳米气泡中的氢气溶解到小分子水中制备出小分子富氢水，本发明的小分子富氢水制备技术将为人类提供全新高度的健康生活。