本发明提供一种酶电极耦合电絮凝去除有机物的方法及反应器，该方法在同一电化学体系联合酶修饰电极和电絮凝协同去除水中有机物，控制一定电化学参数，使阴极反应产生的过氧化氢与酶电极催化有机物发生聚合反应，反应后有机产物经泵进入阳极室，与不同电絮凝水解产物通过压缩双电层、吸附电中和及沉淀网捕等凝聚/絮凝作用而沉淀去除，最终达到阴极酶催化聚合和阳极电絮凝协同去除有机物的目的。本发明不仅对低浓度有毒有机污染物选择性强，对小分子、亲水性有机物去除效果好，而且酶添加量低，阴、阳极充分利用，成本得以降低，操作简单，用途广泛，适用于各种含有机物的水、废水及受污染的水体。