本发明属于水处理技术领域，特别涉及一种硅胶废水的除硅方法。该方法包括如下步骤：（1）混合均质：将硅胶废水在混合池中进行混合、均质处理，水力停留时间1-5小时；（2）水质调节：向硅胶废水中投加碱，将pH调至6-9范围内，水力停留时间2-10小时；（3）混凝除硅：向步骤（2）得到的废水中依次投加氯化钙和氯化镁，混匀后，再向废水中投加氯化铁，形成矾花，最后投加聚丙烯酰胺，经渣水分离得到较清澈的上清液；混凝除硅过程在混凝沉淀池内完成，废水在混凝沉淀池中的水力停留时间大于40分钟。本发明提供的脱硅絮凝剂对硅胶废水中的全硅去除率较高，经过后续的处理可以实现中水回用。