本发明属于海水淡化和水处理技术领域，涉及一种防治反渗透膜或纳滤膜污染的清洗方法，先进行气水两相流清洗或同时化学清洗，再抽取反渗透浓水冲洗反渗透膜表面后，反渗透浓水经浓水排放阀排出；然后将预处理水输送至反渗透模块，将反渗透浓水侧的清洗浓水置换排出，直到电导率恢复到预处理水电导率的98%；最后关闭清洗水排放阀，打开浓水排放阀，反渗透模块恢复正常运行；依次清洗其它各组反渗透模块；其工艺可靠，操作简便，能耗较低，经济和社会效益良好，环境友好。