本发明公开了一种慈姑组培苗快速繁殖培养方法和培养基配方，该方法将脱毒的慈姑外植体培养3周后接种入间歇浸没式生物反应器中，利用间歇浸没式培养方法，持续输入过滤空气，使用不添加糖的液体继代培养基对慈姑组培苗进行培养。本发明采用半自动化，减少了人工操作，降低了组培苗的污染率，并大大提高了慈姑组培苗的增殖率。本发明采用匍匐茎做外植体，采集保存方便，减少慈姑球茎用种量、降低了生产成本和劳动力成本，可在短时间内获得大量组培苗，生产周期缩短，效率高，适于工厂化生产。