一种复合式自控膜生物反应器及其处理低温低浊高色高氨氮水源水的方法，它涉及一种给水处理反应器及给水处理方法。本发明的目的是要解决现有的低温低浊高色高氨氮水处理方法存在成本高，且处理能力低的问题。一种复合式自控膜生物反应器由进水系统、膜生物反应器水处理系统、出水系统、反冲洗系统、排泥系统和投药装置组成，方法：一、首先启动复合式自控膜生物反应器；二、全自动运行。优点：一、实现全自动运行，降低处理成本，提供处理能力；二、采用改性坡缕石替代传统的粉末活性炭，低廉环保，且能有效去除溶解性有机物，有效减缓膜污染。本发明主要用于处理低温低浊高色高氨氮水源水。