本发明提出一种紫外/纯氧微气泡协同处理印染废水的系统及其方法，所述系统包括：纯氧气源装置，微气泡发生器，反应器，紫外灯组，反应器折流板；微气泡发生器包括进水口（2）、进气口（5）以及出水口（6）；反应器一侧底部的反应器进水口（7）与所述微气泡发生器出水口（6）相连；反应器内部安装有紫外灯组（9）以及折流板（12）；反应器另一侧底部设有反应器出水口，顶部设有集气管（11）；集气管与好氧生化处理单元连接。本方法利用纯氧微气泡在紫外协同作用下，与印染废水反应，出水的脱色率可达80%-95%，出水水质较好，且纯氧的传质效率可达99%以上，反应器中溢出的纯氧可重新利用，有效降低废水处理成本。