本发明涉及一种组合型深度处理制药废水的装置；由混凝—过滤预处理装置、卧式多级光催化反应器、厌氧反应器、储水池、反冲洗管线系统等构成；其中混凝—过滤预处理装置通过隔板分隔成混凝缓冲池和碳过滤室两部分，混凝缓冲池侧壁及底部均匀设有曝气头，底部设有排渣口；光催化反应器采用卧式结构，上流式串联多级处理废水；该装置使用混凝—吸附过滤—光催化—厌氧氧化的工艺流程，采用了物理处理技术联合光催化化学氧化技术预处理废水，在厌氧处理前通过预处理去除废水中对活性污泥微生物有毒有害的有机物，在很好地保护了厌氧微生物的同时，增强了厌氧反应的去除效果；该装置对成份复杂的制药废水有良好的去除能力，具有良好的应用前景。