一种发根农杆菌介导的转基因甜叶菊遗传转化方法，本方法将预培养后的甜叶菊茎尖外植体浸入携带目的基因的pRI101-ANDNA质粒的发根农杆菌菌液中，经侵染、共培养及除菌处理后，将发状根培养在含卡那霉素的筛选培养基上，诱导外植体上形成抗卡那霉素的发状根，诱导发状根形成愈伤组织，分化不定芽，不定芽继续生长形成试管苗，利用PCR扩增方法鉴定携带目的基因的转基因植株。采用本发明提供的技术方案，可将目的基因导入甜叶菊，与聚乙二醇等化学方法的遗传转化相比，减少了从原生质体分离和培养的环节；与基因枪等物理方法的遗传转化相比，不需要昂贵的仪器设备，且操作技术简单。