本发明提出一种处理谷氨酸高浓度废水的方法，具体为利用复合酶酶解发酵废弃菌体及利用双极性膜电渗析处理其它废液的方法。本发明过程不仅解决了对谷氨酸高浓度废水中有效成分分离的问题，能够使谷氨酸发酵残糖得到充分的利用，而且能效高，废水排放量少，污染低；此外，电渗析技术具有操作简单、无污染、使用寿命长久等优点，不仅减低企业投资成本，而且节能减排，有一举多得之功效。