本发明公开了一种双甘膦废水的处理方法，首先将双甘膦废水采用吸附法分离出亚氨基二乙腈；其次价加入氢氧化钙，控制溶液的pH值大于8.0，过滤分离出有机钙沉淀物；再者滤液用盐酸调节溶液pH值为3.0-4.0，再加入氯化盐搅拌，之后加入氢氧化钠把溶液的pH值调节至6.0-6.5，继续搅拌，过滤分离出固定沉淀物；最后将刚分离的滤液用盐酸调节pH值为2.0-3.0，并通过活性氧化铝进行吸附，从而得到完全处理后的双甘膦废水。本发明基于络合原理，解决了废水中高浓度氯化钠对双甘膦废水处理的影响，不但可以解决企业面临的废水处理问题，令处理的整个流程操作简单，成本较低，可行性较大，而且可以为企业节约成本，提高企业的竞争力。