本发明公开了一种电吸附模块改性系统及工艺，涉及水处理领域，用以解决现有电吸附系统长期运行过程中由于表面副反应效应的累积，影响电吸附模块除盐效率的问题。系统包括：第一电极和第二电极，在电吸附工作时，组成电吸附模块；第三电极，用于在电吸附模块改性时，作为阳极；改性单元，由作为改性阳极的第三电极，以及在电吸附工作时作为阳极而在改性时作为改性阴极的所述第一电极或第二电极组成，用于对所述改性阴极进行阴极极化，以完成电吸附模块的改性。工艺包括下列步骤：以第三电极作为改性阳极，以第一电极或第二电极作为改性阴极；对作为改性阴极的所述第一电极或第二电极进行阴极极化，以完成电吸附模块的改性；采用所述的系统实施。