本发明涉及一种组蛋白去乙酰化酶抑制剂在制备牙源性干细胞的成骨分化制剂中的应用，本发明对于组蛋白去乙酰化酶抑制剂改变间充质干细胞的乙酰化，应用于药物改变细胞表观遗传学治疗牙周炎及种植体周围炎等疾病，促进骨组织再生有十分重要和深远的意义。本发明提供的两种组蛋白去乙酰化酶抑制剂能够促进牙周炎、骨组织缺损、种植体周围炎患者骨组织的再生，以弥补传统的治疗方法如牙周引导组织再生术(Guide Tissue Regeration,GTR)、牙齿根尖周搔刮术、骨替代品应用、牵张成骨术等骨组织再生的不足。