本发明属于作物生物技术和遗传育种技术领域，具体公开了一种提高秋水仙素诱导三倍体紫锥菊染色体加倍效率的方法。即将三倍体紫锥菊根外植体转移至含有120mg/L秋水仙素的培养基中培养18～25d。由本发明所述根作为外植体成功获得六倍体紫锥菊的比例达到64.71%，与现有技术中所获得的紫锥菊加倍的成功率相比，至少提高了41.21%，本发明有效地克服了三倍体紫锥菊染色体加倍效果差，难以获得六倍体株系的问题。