本发明公开了一种可降解复合生物填料的制备方法，包括如下步骤：1、将秸秆粉碎粉；2、制备活化纤维-蛭石复合体；3制备氧化镁生长液；4、制备吸附有纳米氧化镁生长晶核的纤维-蛭石复合体；5、浸泡吸附有纳米氧化镁生长晶核的纤维-蛭石复合体；6、得到可降解复合生物填料。利用本方法得到的可降解复合生物填料具有更好的挂膜性、界面剪切强度、拉伸强度、稳定性，不会影响微生物的正常生长。