本发明涉及一种快速、高效、选择性降解水中微量苯并芘的方法。经常规生化处理后的含微量苯并芘的废水在臭氧催化氧化反应器内被填料切割成水膜后，同逆向流动的臭氧或臭氧化空气接触、溶解，在分子印迹填料的选择性吸附、催化氧化耦合作用下选择性地降解废水中的微量苯并芘。本发明将分子印迹技术与臭氧催化氧化技术结合，快速、高效、选择性地处理废水中的微量苯并芘，其中臭氧催化氧化反应器在10min内对臭氧的吸收效率达90％以上，使其对微量苯并芘的去除率达到99％以上。本发明可广泛用于涉及苯并芘的各类污废水的深度及再生利用处理。