本发明公开了一种生态菌床污水处理工艺，包括如下步骤：(1)建立池，在池底安装泡沫陶瓷，加入厌氧啤酒污泥；(2)养菌：投加NaCl、Na₂S₄O₆·2H₂O、KH₂PO₄、C₆H₁₂O₆、C₆H₈O₇、NH₄Cl、C₃H₅NaO₃培养剂，碳∶氮∶磷为200-300∶5∶1，按照1∶10000加入配制好的菌种，加污：培养3周后从池底添加行业污水，监测H2S、SS、SO₄^2-、Cr、Pb、COD与色度待去除率达到70％，再逐渐补给污水及排出泥水，维护上述去除率稳定在60％。本发明工艺是种外包式污水处理工艺，无H₂S释出，具有强抗冲击、高效并且使用简便等特点。