本发明公开了一种生物丁醇发酵废水处理并联产有机酸的方法，包括以下步骤：生物丁醇发酵废水泵入装有超高交联吸附树脂的固定床柱进行吸附，用去离子或自来水进行洗杂，用有机溶剂进行洗脱，再用去离子水或自来水进行再生，吸附流出液和洗杂液经补糖返回发酵过程进行重新发酵；洗脱液经常压精馏和减压精馏得到乙酸和丁酸；再生液经过蒸馏回收洗脱剂后进行循环利用。本申请具有工艺流程简单、生产成本低，环境效益和经济效益显著、易于产业化等优点，在解决生物丁醇发酵废水直接排放造成环境污染的问题的同时能够获得具有一定经济价值的有机酸，产品纯度达到98.5％以上，整个工艺过程的总收率最高达95.8％。