本发明提出一种厌氧好氧组合处理有机废水的方法，包括以下步骤：a、将有机废水引入到厌氧反应器中，并对有机废水进行预热，然后停止预热；b、进行厌氧反应，并将经过厌氧反应后的废水引入到中间池；c、对中间池中经过厌氧反应处理的废水进行降温处理，并将降温过程中多余的热量转移到厌氧反应器中；d、将中间池中的废水引入到好氧反应器中进行好氧反应。本发明通过设立中间池，通过热泵系统将经厌氧反应工艺处理的有机废水进行降温，并同时通过热泵系统将其降温过程中吸收的热量返回到厌氧反应器中，免去了厌氧反应中提高有机废水温度而需要的能源，与现有技术相比，节约了能源，同时满足了下一步工艺好氧反应工艺的反应条件。