本发明提供一种育苗和养殖两用的工厂化循环水养殖系统，包括蓄水池，供水管，养殖池，吸水管，第一管道，排污单元，第三管道，水沉淀处理单元，连接管道一，排污闸口，循环管道，第二管道和连接管道二，所述的蓄水池通过供水管设置在养殖池的右侧，为养殖池提供水源；所述吸水管设置在养殖池的中心的纵向位置；所述的第一管道设置连接养殖池的底部与排污单元的中间位置。本发明通过排污单元、水沉淀处理单元、第一管道、第二管道和第三管道的设置，有利于使得育苗与养殖同时进行，提高育苗成活率，还有利于实现当养殖池内水过多时可以通过连接管道二直接流到循环管道，进而使得节约资源，提高养殖收益，进一步降低维护成本，提高养殖效率。