本发明公开了一种利用纳米铁材料去除水体中藻类的方法，包括以下步骤：(1)对藻液进行预氧化；(2)调节藻液的pH值至碱性；(3)在藻液中加入纳米四氧化三铁和聚丙烯酰胺；(4)藻液经搅拌后沉降，藻液中的藻被去除。选取水华爆发时蓝藻中的优势藻种铜绿微囊藻和绿藻中的优势藻种斜生栅藻作为研究对象，开发了在KMnO₄预氧化的条件下，配合使用纳米四氧化三铁和聚丙烯酰胺作为混凝剂对藻的去除方法，在药品投加量相对较低的情况下，能够很大程度上提高藻的去除率和沉降速率。无需使用含铝的混凝剂，可减少环境中铝盐的继续增加。