本发明公开了一种基于膜生物反应器污水处理方法。处理过程包括好氧反应处理和膜生物反应处理，污水先经过好氧反应区进行好氧反应，经好氧反应区曝气后的污水经好氧出水管进入厌氧反应区进行膜生物反应，厌氧反应区使用好氧反应区排出空气对膜组件进行冲洗曝气；同时鼓风机对膜组件底部进行曝气，控制曝气量，使膜组件内部区域溶解氧为0.2～0.5mg/L，处理厌氧环境。本发明的污水处理方法，空气经过好氧反应区反应后，氧气含氧量很低。膜组件处于厌氧环境，避免膜组件形成好氧膜生物反应器，减少膜污染、堵塞、减缓膜通量降低的速度。在厌氧环境中，聚磷菌将体内的磷排除到污泥中，直接通过气化除磷，将污水中的磷以磷化氢排出。