厌氧产甲烷厌氧氨氧化联合处理大豆蛋白废水装置及方法，属于污水处理技术领域。设有进水水箱，进水水箱通过第一进水泵和管道与厌氧SBR反应器连通；厌氧SBR反应器设有反应区、顶部区，反应区底部设有与空气压缩机连通的微孔曝气头，反应区上部为顶部区；在反应区和顶部区之间设有第一溢流堰，第一溢流堰外部与出水管路相通；在反应区顶部设有出气口和气体回流管路。方法包括以下步骤：1)接种污泥；2)启动阶段；3)连续运行。本发明适用于大豆蛋白生产工艺产生的高COD、高氨氮废水的处理；也适用于其他高氨氮工业废水的脱氮处理。工艺完善，控制灵活，运行成本低，污水处理效果好，效率高。