本发明公开了一种杀藻剂在杀灭和控制微囊藻水华中的用途。三氯生和琥珀酸等三羧酸循环中间产物有机羧酸对微囊藻水华的杀灭和控制作用。在室内实验条件下，0.5ppm的三氯生对微囊藻即具有致死作用；在野外条件下，5-15ppm的三氯生可杀灭微囊藻水华群体。在实验条件下，0.01%浓度的琥珀酸对微囊藻具有致死作用；在野外条件下，0.1%的琥珀酸可杀灭微囊藻水华群体。苹果酸和Alpha-酮戊二酸效果次之，柠檬酸和延胡索酸也具有较好的溶藻效果。有机羧酸的溶藻作用主要归因于pH值的迅速降低，为休克酸化。三氯生主要是可用来作为强力杀藻剂，安全无毒、环保、效率高、见效快。