本发明公开了一种复合阻垢缓蚀剂及其应用以及循环水的处理方法，该复合阻垢缓蚀剂含有分散剂、有机膦酸阻垢缓蚀剂和锰盐，所述分散剂、有机膦酸阻垢缓蚀剂和锰盐的重量比为1:0.1-2:0.025-0.5，其中锰盐的重量按锰离子计。本发明的复合阻垢缓蚀剂与非氧化型杀菌剂特别是异噻唑啉酮具有较好的协同效应，能明显提高异噻唑啉酮的杀菌效果，表现为杀菌快和药效时间长。另外本发明的复合阻垢缓蚀剂对钙和碱容忍度高，对水质的适应范围宽，对总硬度与总碱度之和在300mg·L^-1以上的水质以及总硬度与总碱度之和在100mg·L^-1以下的水质都具有优良的阻垢缓蚀性能，易于推广应用。