本发明公开了一种用于含藻废水处理的高效复合式净化系统，包括一净化容器，其特征在于：净化容器由下至上依次由过滤室(1)、等离子体反应室(2)、絮凝室(3)和集水室(4)组成，所述过滤室(1)与等离子体反应室(2)之间设有滤网，所述等离子体反应室与絮凝室之间设有筛网层；所述净化容器位于过滤室处设有进水口，位于集水室处设有出水口。本发明采用集成化组合工艺，占地面积小、除藻效率高、药剂使用量小、出水水质好；系统采用等离子体放电氧化除藻，大大降低了恶臭气体的散发，降低了恶臭气体对大气环境的污染，该系统不仅具有高效除藻率，而且对于SS、COD_Cr也有较好的去除效果。