本发明公开了一种百合的根尖脱毒与快繁方法，该方法为：采用百合根尖作为外植体，将该外植体接种在根尖伸长培养基上培养，使得外植体根尖拉长；将前述根尖拉长的外植体接种在体胚诱导培养基上培养，诱导所述拉长的根尖产生胚性愈伤组织，达到脱毒和再生的目的。将前述胚性愈伤组织接种到分化生根培养基上培养即发育为完整的试管苗。发育后的试管苗可采用RT-PCR方法检测是否含有病毒。利用本发明，将传统的茎尖脱毒改为根尖脱毒，简化了操作程序，避免了脱毒过程中的高污染率，显著提高了工作效率，且接种体在培养基上生长良好，试管苗繁殖系数高，脱毒彻底，移栽成活率达98％以上。