本发明公开了一种通过单室燃料电池处理含硫废水回收单质硫并联产电能的方法，以单室燃料电池为反应器，以铂碳为催化剂的空气电极为阴极，以碳材为阳极，所述阳极插入反应器内的电解质溶液中并通过导线与反应器外的阴极相连，所述反应器与所述阴极之间设置有阳离子交换膜；在燃料电池开路的状态下向电解质溶液中加入缓冲剂、配位剂以及Fe(III)化合物，调节电解质溶液的pH值至5-9，然后通氮除氧，随后向电解质溶液中加入硫化物，室温下密闭反应器反应7-9h。本发明方法单质硫的转化率达到98.5%，库伦效率达到75%以上。本发明适用于工业上含硫化物废水中硫单质和电能的回收再利用。