本发明公开了一种利用光合细菌处理食品加工废水并实现资源化的方法，属于污水处理技术领域。本发明首先向食品加工废水中投加小分子碳源物质到终浓度为160~2000 mg/L以及小分子氮源物质到终浓度为55~1000 mg/L；再调节废水的pH值为7.0~9.0；然后向废水中投加处于对数生长期的沼泽红假单胞菌到终浓度为240~2000 mg/L；在25~30℃下处理96~120小时；同时采用白炽灯控制外加光照强度为500~1500 lux和控制污水中的溶解氧浓度为0.5~1.0 mg/L。本发明操作简单易行，简化了工艺流程，提高了污水资源化程度，避免了传统污水处理工艺的二次污染问题并能降低能耗。