本发明涉及一种利用兼性海洋真菌活体修复钍(Ⅳ)污染水体的方法。以兼性海洋真菌Fusarium sp.#ZZF51活体为材料，投放于含钍(Ⅳ)污染的水体中，一段时间之后，将之打捞并进行集中处理。真菌材料具有强耐盐抗辐射性。真菌富集钍(Ⅳ)能力强，自投放后2-8 h即可达到70%-80%的去除率。真菌活性菌丝体浮于水体表面，易于打捞和集中处理。操作、管理简便、成本低、修复效率高，对环境友好，无二次污染等经济和技术优势。它适用于钍矿山、水冶厂以及各种废矿石和尾矿浸出液等各种钍污染水体的后期处理。