本发明涉及一种处理亚甲基蓝染料废水的方法，先将硅藻土与钙质原料、碱激发剂、水混匀，压制成型后放入高压水热反应釜中，100～200℃反应1～48h，得到含C-S-H、托勃莫来石、方沸石的硅藻土基多孔吸附剂；然后将其放入盛有液体培养基的锥形瓶，加入5%～20%质量百分比的酵母粉，调节pH为5～8，在速度60rpm～120rpm的往复摇床上，以15～35℃的恒温条件培养2h～48h即得到负载酵母的硅藻土基多孔吸附剂；最后在每升浓度为100～1000mg/L的亚甲基蓝染料废水中加入负载酵母的多孔吸附剂1～10g，在pH=4～10，速度为60rpm～120rpm的往复摇床上，在25～45℃处理1h～48h，通过分光光度计法测量处理后亚甲基蓝废水的浓度，结果表明，亚甲基蓝染料的去除率超过90%。本发明工艺简单、成本低廉、无二次污染，适宜于亚甲基蓝染料废水的工业化处理。