本发明涉及一种全自动智能防垢杀菌清洗过滤器及其水处理系统，包括壳体，所述壳体顶部通过紧固件与密封装置安装有上封头，位于壳体内底部设置有过滤网支座，位于壳体内上部安装有过滤网支撑板，所述过滤网支座与过滤网支撑板之间安装过滤网；所述过滤网的顶部安装盖板，所述盖板与过滤网顶部以及过滤网支撑板通过紧固件连接；位于盖板上部的壳体侧壁上设置有进水口，位于盖板下部的壳体侧壁上设置有出水口。其精微过滤器包括有杀菌系统，除垢清洗装置，将过滤、杀菌、除垢的功能结构为一体，其结构紧凑，实现多功能作用，工作效率高，使用寿命长。