本发明公开了一种水产用复合微生态制剂及其制备方法，所述的添加剂是一种由四种菌及其发酵产物按照一定比例混合而成的复合微生态制剂，由如下重量组分组成：枯草芽孢杆菌菌粉0.20～0.50份，巨大芽孢杆菌菌粉0.20～0.60份，环状芽孢杆菌菌粉0.20～0.50份，热带假丝酵母菌粉0.05～0.30份；本复合微生态饲料添加剂具有制造工艺简单，菌种易得，成本低的特点，且无毒副作用，无残留。本发明的复合微生态饲料添加剂应用于水产，即可为一种饲料添加剂，能够改善饲料品质，提高饲料中粗蛋白的含量，降低饲料中粗纤维的含量，也兼具改善水产养殖水质作用，是一种新型安全可靠、无污染的纯发酵多功能的新型微生态制剂产品。