本发明公开了一种用于污染河涌沉积物原位生态修复的复合生物促生剂。该复合生物促生剂由氧化剂和生物促生剂组成；氧化剂为过氧化钙或硝酸钙中的一种或两种；生物促生剂包括氨基酸、小分子有机酸、维生素、无机盐和微量元素。本发明针对河涌底泥特点，筛选得到氧化剂及生物促生剂成分，可根据河涌底泥污染程度进行氧化剂配比质量的调整，因为不含有微生物，不会对底泥造成生态风险。同时通过刺激底泥土著微生物的生长繁殖，建立了耐污性底泥微生态系统，使底泥的修复效果能够在较长的时期内维持在较好的状态。试验研究表明，使用本发明中的复合生物促生剂，可使底泥中TOC含量下降，微生物多样性及活性升高。