本发明公开了一种复配菌种及利用其处理工业污泥的方法，一种复配菌种，组成以质量比计为：纳豆菌粉：乳酸菌粉：排硫硫杆菌粉=1：0～50:0～30；其中，乳酸菌粉和排硫硫杆菌粉不同时为0。利用所述的复配菌种处理工业污泥的方法，按照复配菌种和工业污泥的质量比为1:10～100000将复配菌种接种至工业污泥中，培养12h以上。本发明操作管理简单、运行费用低、安全可靠。