本发明属于饮用水处理技术领域，特别涉及一种预氧化强化藻细胞混凝并控制藻细胞内有机物释放的方法。本发明针对湖泊、水库等地表水源富营养化污染，提出了一种依次投加预氧化剂与亚铁盐和铁盐等的方法，预氧化剂灭活藻细胞，而亚铁盐终止预氧化，以控制藻细胞内的有机物的继续释放，同时亚铁盐氧化生成的新生态三价铁及铁盐作为混凝剂；经预氧化的藻细胞的混凝得到强化。本发明主要应用于饮用水厂净化，也可应用于以景观水体回用为目标的景观水处理以及富营养化水体的水源预处理以抑制藻细胞生长。