本发明属于饮用水处理技术领域，特别涉及一种基于原位生成双混凝剂的预氧化-混凝除藻的方法。本发明针对湖泊、水库等地表水源富营养化污染，提出了一种依次投加氧化剂、亚铁盐与铝盐等的方法，预氧化剂灭活藻细胞，而亚铁盐终止预氧化，以控制藻细胞内的有机物的继续释放，同时亚铁盐氧化生成的新生态三价铁与铝盐作为双混凝剂；经预氧化的藻细胞的混凝得到强化。本发明主要应用于饮用水厂净化，也可应用于以景观水体回用为目标的景观水处理，以及富营养化水体的水源预处理以抑制藻细胞生长。