本发明公开了一种利用微生物处理水煤浆气化废水的方法，废水依次进入调节池、多功能池、复合脱氮池和沉淀池，最终达标出水；在多功能池添加有搅拌和曝气装置，复合脱氮池内配有曝气装置；并且分别于多功能池和复合脱氮池中加入各自体积1.0%~2.5%的微生物载体以及1.5%~4.0%的环境微生物制剂。经本发明处理后，水煤浆气化废水氨氮可以控制在15mg/L以下，COD可以控制在100mg/L以下，其它指标也可以达到《污水综合排放标准》（GB8978-1996）国家一级排放标准。