一种船载离心脱水系统，它包括船，船上装有动力装置和电器控制系统，电器控制系统控制有船载绞吸装置，船载绞吸装置输出端安装有旋转折叠栅格架，旋转折叠栅格架下方装有分筛池和临时存储池，临时存储池内装有螺旋输送装置，分筛池内装有搅拌装置，分筛池输出端装有淤泥切割机输送装置，淤泥切割机输送装置输出端装有卧螺离心装置，卧螺离心装置上装有加药系统，卧螺离心装置的输出端连接有输送器系统。本发明提供的用于河道清理的船载离心脱水系统，它将离心脱水系统移植于船上，变固定场地脱水变为为船上动态脱水，使淤泥脱水过程更灵活，减少将淤泥运送到陆地而对陆上环境产生的二次污染。