本发明公开了藻类收集及转输装置，并利用该装置提供了自动收集、去除水中漂浮藻类的装置及方法。藻类收集及传输装置中部设有凹槽，凹槽相对两侧壁的上沿分别设有向下的坡面，坡面上分别设有两片进水挡板，坡面与进水挡板围成进水口。自动收集、去除水中漂浮藻类的装置由藻类收集及转输装置、藻类聚集浓缩及清除装置串联而成。本发明自动收集、去除水中漂浮藻类的方法包括漂浮藻类的收集、收集藻类的转输、藻类的集聚及清除、藻类的终端处理等步骤，有效清除了水中富集的藻类。本发明采用物理方法避免了二次污染，一次投入小、使用成本低，对于清除水中富集的藻类具有显著的效果。