本发明属于水处理药剂技术领域，具体涉及一种循环水用杀菌灭藻剂及其制备方法。由如下重量百分比的原料制成：聚二氯乙基醚四甲基乙二胺6-50％、双氧水8-20％、脂肪醇聚氧乙烯醚0.3-2％、羟基乙叉二膦酸0.5-8％、去离子水余量。制备方法是将去离子水、聚二氯乙基醚四甲基乙二胺、脂肪醇聚氧乙烯醚、羟基乙叉二膦酸、双氧水依次按组份含量加入同一反应釜内，在温度为10-35℃下搅拌30-60分钟即得。本发明是循环水为中水、废水的水系统专用杀菌灭藻剂，对此类循环水中的微生物和青苔杀灭性更强、更持久、更彻底，对微生物产生的粘泥剥离更好；杀菌灭藻效果快速、明显，用量少，且不起泡沫，利于工业生产。