本发明公开了一种新型的脱硫废水综合处理工艺，脱硫系统中来的废水经进水管（1）进入废水缓冲池（4）；废水缓冲池（4）内的废水通过提升泵（3）提升到中和箱（9），所述中和箱（9）的进口端通过石灰加药泵（7）加入石灰溶液，从而将废水的pH调至9.0左右；所述石灰加药泵（7）的输入端连接石灰溶液计量箱（6）。且因系统中设置有两级澄清器，每级澄清器可根据进水水质情况单独设计，如二级澄清器表面负荷可以提高20-30%，比传统的单级澄清器更有效率。