本发明公开了一种银杏组织培养外植体消毒的方法。本发明介绍了银杏组织培养中不同外植体的处理和消毒方法，以降低银杏组培的污染率，和因处理不当造成的死亡率。本发明利用银杏组织培养中常见外植体：茎段，胚，冬芽，在传统的组培消毒方法上进行了部分改良，从而提高了外植体接种的成活率，达到提高银杏组培繁殖的效率和产量的目的。本方法对银杏外植体进行消毒处理，操作简单、可行。