本实用新型公开了一种植物组织培养外植体消毒装置，包括消毒瓶、消毒筒、滤网和上盖，在消毒瓶和消毒筒内中部上分别固定安装有一个滤网，消毒筒的下端与消毒瓶开口端螺纹密封连接且与消毒瓶相连通，上盖扣合在消毒筒的上端，在消毒瓶的下部接近底面处设有排液口，排液口上安装有一水龙头。本实用新型结构简单，操作方便。通过设置消毒瓶和消毒筒，能同时对不同的外植体进行消毒，能减少实验时工作量，提高工作效率；消毒时，不同的外植体材料放置在滤网上即可进行后续消毒操作，消毒后可通过水龙头排掉消毒液，不用担心外植体材料的流失，又能方便从滤网上取出外植体，给实验操作带来很大的便利。