本发明涉及一种低成本去除污水中有机磷的方法，其特征在于，首先选取价格低廉的人工弹性填料为光合生物膜富集材料，然后对光合生物膜富集材料进行设计和修饰，使其能够快速稳定富集微生物形成生物膜，同时根据实际工程所需，设计相应规模的尺度和面积的处理系统，在受污水体中进行布置，从而对污水中有机磷产生有效的去除效果。本发明制备的光合生物膜处理有机磷系统的优势在于：对有机磷的转化和去除有较好的效果；更适合于大面积、大尺度的面源污水处理，具有成本低廉，充分利用太阳能，耗能低，不额外占用昂贵的土地资源等优势；充分利用光合生物膜将面源污水中磷捕获，在进行加工，实现磷资源的回收利用。