本发明公开了一种口腔内种植体的扫描方法及系统，所述方法将与口腔内种植体型号相对应的扫描杆固定在种植体上；通过口内扫描仪对口腔进行取像，获取口腔内的三维数据；口内扫描仪将所述三维数据通过无线网络上传到系统；系统将种植体数据库与所述扫描杆进行匹配，设计基台的外形、牙冠的形态和带孔的模型，并将数据传输给加工设备；所述加工设备根据包含有基台的外形、牙冠的形态和带孔的模型的数据，自动加工出对应的基台、牙冠和模型。由此，实现了种植体取印模的数字化，提高了基台和牙冠设计的精度，实现了扫描、设计、加工的无缝连接，提高了生产效率。